1.转录组比对软件STAR安装及使用
2.SRS流媒体服务器——单机环境搭建和源码目录介绍
3.Star技术论坛旗下站点

转录组比对软件STAR安装及使用

       STAR，日本这个转录组比对工具，电视是台源ENCODE计划的重要工具，在转录组文章中常被提及。码日其特点包括较高的本电唯一比对率、将未配对映射的视台ebbi公式源码reads剔除、对质量较低的源地比对有较高容忍度等。使用GATK对RNA-Seq进行变异位点调用时，日本会采用STAR的电视2-pass模式。在使用过程中，台源需注意正确设置参数以避免错误。码日

       在进行STAR的本电安装时，先从GitHub下载对应的视台泡泡屏源码版本，使用tar命令解压，源地然后进入源代码目录使用make命令构建程序。日本在解压目录下，有多个可运行的STAR命令，选择其中一个执行，例如第二个版本的STAR命令。

       构建基因组索引是STAR使用的关键步骤。通过设置参数，如线程数、运行模式、基因组目录、参考基因组文件、板块名称源码注释文件、reads长度最大值等，完成索引构建。在构建过程中，需注意参数选择，如使用正确的染色体命名方式。若在构建过程中遇到错误，需检查输入的文件格式、内容及参数设置。

       STAR具有大量的参数设置，包括比对时允许的最大错配数、MAPQ值调整、traefik源码解析reads文件操作、输入FASTQ文件路径、唯一剪切位点的reads考虑、内含子长度设定等。通过合理设置这些参数，可以优化比对结果，满足后续分析需求。

       在比对完成后，通过samtools查看生成的BAM文件，可以得到reads在基因组和转录本上的比对位置、统计信息、剪切位点信息等结果。驱动sys源码分析这些结果时，需要关注BAM文件的处理过程，如去重等。

       总结来说，STAR在转录组比对方面有其独特的优势和使用技巧，但其参数设置复杂，需根据具体情况进行合理选择。正确使用STAR，可以提高比对效率和准确性，为后续的转录组分析提供坚实的基础。

SRS流媒体服务器——单机环境搭建和源码目录介绍

       启动srs

       2. 显示日志信息

       3. 确认srs是否正常启动

       4. 安全退出正在运行的srs

       5. 默认后台启动，调试需修改配置文件为前台

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       源码目录介绍

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