1.【插件介绍】点云处理插件COCKROACH
2.Bader电荷分析详解

【插件介绍】点云处理插件COCKROACH

       COCKROACH插件是码下一款开源的点云处理工具，由Petras Vestartas和Andrea Settimi共同开发。码下

       此插件依托于Open3D、码下CGAL和Cilantro库，码下代码可在Github上找到：github.com/9and3/Cockro...

       开源的码下初衷是为了打造一个面向.NET的开放源代码点云处理工具，开发者期望有更多人为其贡献，码下源码在线解析网站增添更多功能。码下

       以下通过开发者提供的码下案例，详细解析COCKROACH插件的码下功能。

       包括：拾取点云、码下输出点云信息；按点数降低点云采样；按Voxel大小采样，码下Voxel越大，码下点云数越小；以box裁剪点云，码下支持反向裁剪；以多段线裁剪点云；以平面去切点云；根据颜色和点大小显示点云；显示点云的码下法向量；用点云创建网格；网格修复；网格的中心骨架；把网格转成点云；布尔网格等。

       插件下载方面，码下源码网站运营COCKROACH插件提供了多种方式。

       1. 可通过Food4Rhino下载COCKROACH插件，搜索插件名称，找到对应版本即可下载。下载链接：food4rhino.com/en/app/c...

       注意：下载Grasshopper版本时，请选择倒数第二个版本，以免下载错误。ps源码网站

       2. 第二种方法仅支持Rhino版本安装，不支持Grasshopper版本。使用程序集管理包（PackageManager）进行下载，在犀牛7中执行_PackageManager指令，搜索COCKROACH插件直接安装。

       3. 如果熟悉代码，还可以从github下载COCKROACH插件的菜鸟商城源码源代码。github.com/9and3/Cockro...

       Grasshopper版本安装完成后，即可使用。

Bader电荷分析详解

       Bader电荷分析是第一性原理计算中的一个重要工具，首次由Richard Bade在McMaster University提出。通过分析计算结果，可以精确地获取原子周围的电子分布，从而估算原子的源码比对工具化合价。

       Henkelman课题组开发了一个高效程序，能够处理VASP的CHGCAR文件和Gaussian的CUBE文件，支持Linux和MAC OS X平台。用户可以下载该程序的编译好的可执行文件或源代码自行编译，获取详细信息请访问：theory.cm.utexas.edu/he...

       Bader电荷分析的基本流程包括：首先进行结构优化，接着基于优化结构进行静态计算，并保存为POSCAR格式，最后配置INCAR参数进行Bader电荷计算。

       Bader电荷有直接计算和精确计算两种方式。直接计算通过执行命令“bader chargefile”进行，输出文件包括ACF.dat、BCF.dat和AtomVolumes.dat。Bader原子体积可通过指定参数输出，并使用VMD、Jmol、VESTA或支持CUBE文件的程序如GaussView进行可视化。

       精确计算则涉及到VASP的CHGCAR文件处理，该文件仅包含价电荷密度。Bader分析假设电荷密度最大值位于原子中心，但赝势影响了这一假设。VASP中的aeden模块可从PAW计算中输出核心电荷，需要将LAECHG=. true添加至INCAR文件中，生成AECCAR0、AECCAR1、AECCAR2文件。使用chgsum.pl脚本进行求和后，执行命令生成ACF.dat、AVF.dat、BCF.dat文件。正确总电荷的重现需要精细的fft网格，需要通过计算测试NG(X,Y,Z)F方案的可靠性，直至总电荷正确为止。