1.Seurat 4 源码解析 8: step4 QC可视化 VlnPlot()
2.HUE从安装到塌方
3.电脑页面的端源端源什么特效？
Seurat 4 源码解析 8: step4 QC可视化 VlnPlot()
本文旨在深入解析Seurat 4.1.0版本中用于质量控制和可视化的VlnPlot()函数，为不同层次的码前码网用户提供全面理解。VlnPlot()函数是端源端源Seurat分析流程中的关键组成部分，帮助用户以可视化形式评估数据质量，码前码网从而为后续分析提供可靠依据。端源端源下面，码前码网资源海源码我们将逐步解析该函数的端源端源实现原理及用途。
VlnPlot()函数的码前码网实现基于R语言，位于seurat-4.1.0/R/visualization.R:文件中。端源端源其核心逻辑简洁而高效，码前码网通过一个if语句判断新版本的端源端源split.by功能是否发生变化，根据实际情况返回ExIPlot()函数。码前码网这个函数不仅揭示了Seurat包在设计时注重用户友好性和错误提示的端源端源特性，也展现了其内部结构的码前码网复杂性。
ExIPlot()函数则在文件中占据更多空间，端源端源定义在seurat-4.1.0/R/visualization.R:。它主要调用了SingleExIPlot()函数，通过这个函数进一步细化表达与身份的可视化。SingleExIPlot()函数在代码的uvmseqencer源码最后十几行中首次调用ggplot2库，展示数据可视化的过程。
在解析过程中，我们还探讨了与VlnPlot()函数相关的其他函数，如DefaultAssay<-()、AutoPointSize()、InvertHex()、interaction()等，它们在数据处理、颜色生成、源码dts颜色反转、交互作用计算等不同环节发挥着关键作用。其中，AutoPointSize()函数用于自动调整散点图中点的大小，InvertHex()则提供了一种将颜色从进制转换为互补色的方法，进一步丰富了数据可视化的表现形式。
本文还提到了一些R语言技巧，如如何控制函数参数改变时的提示显示次数、合理设置图形列数、tmts源码自动获取差异尽可能大的颜色以及如何使用Scales库中的hue_pal()函数等。这些技巧对于提升R语言编程效率和数据可视化质量具有重要意义。
总结而言，VlnPlot()函数是Seurat包中用于质量控制和可视化的强大工具，通过其内部实现逻辑和与之相关的辅助函数，为用户提供了一种高效、直观的方法来评估和理解单细胞转录组数据的质量。通过深入解析这些函数的实现细节，用户不仅可以更好地利用Seurat包进行数据分析，nrfuart 源码还能进一步提升数据可视化能力，为科学研究提供有力支持。
HUE从安装到塌方
Hue：集成界面的友好选择 作为一个功能强大的界面集成框架，Hue旨在将我们学习和即将接触的各种框架整合在一个简洁的界面中，使得数据处理和监控变得易如反掌。它拥有类似的竞争产品如Apache Zeppelin。 安装Hue的过程相对复杂，官方并未提供预编译的安装包。为了确保顺利安装，建议在没有安装过MySQL的节点上操作，以避免版本冲突。以下是在Linux系统上安装Hue的详细步骤：首先，你需要下载两个软件包：hue-release-4.3.0.zip和apache-maven-3.6.3bin.tar.gz，然后将它们上传并解压。
接下来，确保安装必要的依赖包，这对于构建Hue环境至关重要。
安装Maven，这是Hue构建和管理项目所依赖的构建工具。
然后，开始Hue的编译过程，将源代码转换为可执行的程序。
配置Hadoop，确保Hue能与Hadoop生态系统无缝协作。
最后，对Hue进行个性化配置，并启动服务，完成集成环境的搭建。
一旦Hue成功整合了HDFS、YARN、Hive以及MySQL，你可以重启Hue服务，开始享受集成后的高效数据分析体验。电脑页面的什么特效？
这个是html5的效果，以下是源代码：
<!DOCTYPE html>
<html xmlns="/texiao/html5/index/hovertreewelcome.css" type="text/css" rel="stylesheet" />
</head>
<body ondragstart="window.event.returnValue=false" oncontextmenu="window.event.returnValue=false" onselectstart="event.returnValue=false">
<div id="hovertreecontainer">
<div>
<h1 id="h1">何问起 </h1>
<h2 id="h2"> 想问候，不知从何问起，就直接说喜欢你！</h2>
<h3 id="h2">hovertree.com为您提供前端特效,ASP.NET等设计开发资料。<a href="/hvtart/bjae/onxw4ahp.htm">原文</a> <a href="/texiao/">特效</a></h3>
<p> </p>
<p><strong><a href="/">进入主站</a></strong></p>
<p> </p>
<p> </p>
<p> </p>
<p> </p>
<p> </p>
</div>
</div>
<canvas id="canvas"></canvas>
<audio autoplay="autoplay">
<source src="" type="audio/ogg">
<source src="/hovertreesound/hovertreexihuanni.mp3" type="audio/mpeg">
您的浏览器不支持播放音乐。请用支持html5的浏览器打开,例如chrome或火狐或者新版IE等。
<br />何问起 hovertree.com
</audio><script type="text/javascript" src="/texiao/html5/index/hovertreewelcome.js">
</script>
<script type="text/javascript">
; (function (window) {
var ctx,
hue,
logo,
form,
buffer,
target = { },
tendrils = [],
settings = { };
settings.debug = true;
settings.friction = 0.5;
settings.trails = ;
settings.size = ;
settings.dampening = 0.;
settings.tension = 0.;
Math.TWO_PI = Math.PI * 2;
// ========================================================================================
// Oscillator 何问起
// ----------------------------------------------------------------------------------------
function Oscillator(options) {
this.init(options || { });
}
Oscillator.prototype = (function () {
var value = 0;
return {
init: function (options) {
this.phase = options.phase || 0;
this.offset = options.offset || 0;
this.frequency = options.frequency || 0.;
this.amplitude = options.amplitude || 1;
},
update: function () {
this.phase += this.frequency;
value = this.offset + Math.sin(this.phase) * this.amplitude;
return value;
},
value: function () {
return value;
}
};
})();
// ========================================================================================
// Tendril hovertree.com
// ----------------------------------------------------------------------------------------
function Tendril(options) {
this.init(options || { });
}
Tendril.prototype = (function () {
function Node() {
this.x = 0;
this.y = 0;
this.vy = 0;
this.vx = 0;
}
return {
init: function (options) {
this.spring = options.spring + (Math.random() * 0.1) - 0.;
this.friction = settings.friction + (Math.random() * 0.) - 0.;
this.nodes = [];
for (var i = 0, node; i < settings.size; i++) {
node = new Node();
node.x = target.x;
node.y = target.y;
this.nodes.push(node);
}
},
update: function () {
var spring = this.spring,
node = this.nodes[0];
node.vx += (target.x - node.x) * spring;
node.vy += (target.y - node.y) * spring;
for (var prev, i = 0, n = this.nodes.length; i < n; i++) {
node = this.nodes[i];
if (i > 0) {
prev = this.nodes[i - 1];
node.vx += (prev.x - node.x) * spring;
node.vy += (prev.y - node.y) * spring;
node.vx += prev.vx * settings.dampening;
node.vy += prev.vy * settings.dampening;
}
node.vx *= this.friction;
node.vy *= this.friction;
node.x += node.vx;
node.y += node.vy;
spring *= settings.tension;
}
},
draw: function () {
var x = this.nodes[0].x,
y = this.nodes[0].y,
a, b;
ctx.beginPath();
ctx.moveTo(x, y);
for (var i = 1, n = this.nodes.length - 2; i < n; i++) {
a = this.nodes[i];
b = this.nodes[i + 1];
x = (a.x + b.x) * 0.5;
y = (a.y + b.y) * 0.5;
ctx.quadraticCurveTo(a.x, a.y, x, y);
}
a = this.nodes[i];
b = this.nodes[i + 1];
ctx.quadraticCurveTo(a.x, a.y, b.x, b.y);
ctx.stroke();
ctx.closePath();
}
};
})();
// ----------------------------------------------------------------------------------------
function init(event) {
document.removeEventListener('mousemove', init);
document.removeEventListener('touchstart', init);
document.addEventListener('mousemove', mousemove);
document.addEventListener('touchmove', mousemove);
document.addEventListener('touchstart', touchstart);
mousemove(event);
reset();
loop();
}
function reset() {
tendrils = [];
for (var i = 0; i < settings.trails; i++) {
tendrils.push(new Tendril({
spring: 0. + 0. * (i / settings.trails)
}));
}
}
function loop() {
if (!ctx.running) return;
ctx.globalCompositeOperation = 'source-over';
ctx.fillStyle = 'rgba(8,5,,0.4)';
ctx.fillRect(0, 0, ctx.canvas.width, ctx.canvas.height);
ctx.globalCompositeOperation = 'lighter';
ctx.strokeStyle = 'hsla(' + Math.round(hue.update()) + ',%,%,0.)';
ctx.lineWidth = 1;
if (ctx.frame % == 0) {
console.log(hue.update(), Math.round(hue.update()), hue.phase, hue.offset, hue.frequency, hue.amplitude);
}
for (var i = 0, tendril; i < settings.trails; i++) {
tendril = tendrils[i];
tendril.update();
tendril.draw();
}
ctx.frame++;
ctx.stats.update();
requestAnimFrame(loop);
}
function resize() {
ctx.canvas.width = window.innerWidth;
ctx.canvas.height = window.innerHeight;
}
function start() {
if (!ctx.running) {
ctx.running = true;
loop();
}
}
function stop() {
ctx.running = false;
}
function mousemove(event) {
if (event.touches) {
target.x = event.touches[0].pageX;
target.y = event.touches[0].pageY;
} else {
target.x = event.clientX
target.y = event.clientY;
}
event.preventDefault();
}
function touchstart(event) {
if (event.touches.length == 1) {
target.x = event.touches[0].pageX;
target.y = event.touches[0].pageY;
}
}
function keyup(event) {
switch (event.keyCode) {
case :
save();
break;
default:
// console.log(event.keyCode); hovertree.com
}
}
function letters(id) {
var el = document.getElementById(id),
letters = el.innerHTML.replace('&', '&').split(''),
heading = '';
for (var i = 0, n = letters.length, letter; i < n; i++) {
letter = letters[i].replace('&', '&');
heading += letter.trim() ? '<span class="letter-' + i + '">' + letter + '</span>' : ' ';
}
el.innerHTML = heading;
setTimeout(function () {
el.className = 'transition-in';
}, (Math.random() * ) + );
}
function save() {
if (!buffer) {
buffer = document.createElement('canvas');
buffer.width = screen.availWidth;
buffer.height = screen.availHeight;
buffer.ctx = buffer.getContext('2d');
form = document.createElement('form');
form.method = 'post';
form.input = document.createElement('input');
form.input.type = 'hidden';
form.input.name = 'data';
form.appendChild(form.input);
document.body.appendChild(form);
}
buffer.ctx.fillStyle = 'rgba(8,5,)';
buffer.ctx.fillRect(0, 0, buffer.width, buffer.height);
buffer.ctx.drawImage(canvas,
Math.round(buffer.width / 2 - canvas.width / 2),
Math.round(buffer.height / 2 - canvas.height / 2)
);
buffer.ctx.drawImage(logo,
Math.round(buffer.width / 2 - logo.width / 4),
Math.round(buffer.height / 2 - logo.height / 4),
logo.width / 2,
logo.height / 2
);
window.open(buffer.toDataURL(), 'wallpaper', 'top=0,left=0,width=' + buffer.width + ',height=' + buffer.height);
// form.input.value = buffer.toDataURL().substr();
// form.submit(); hovertree.com
}
window.requestAnimFrame = (function () {
return window.requestAnimationFrame || window.webkitRequestAnimationFrame || window.mozRequestAnimationFrame || function (fn) { window.setTimeout(fn, / ) };
})();
window.onload = function () {
ctx = document.getElementById('canvas').getContext('2d');
ctx.stats = new Stats();
ctx.running = true;
ctx.frame = 1;
logo = new Image();
logo.src = 'ht' + 'tp://ho' + 'vertree.c' + 'om/themes/hvtimages/hvtlogo.p' + 'ng';
hue = new Oscillator({
phase: Math.random() * Math.TWO_PI,
amplitude: ,
frequency: 0.,
offset:
});
letters('h1');
letters('h2');
document.addEventListener('mousemove', init);
document.addEventListener('touchstart', init);
document.body.addEventListener('orientationchange', resize);
window.addEventListener('resize', resize);
window.addEventListener('keyup', keyup);
window.addEventListener('focus', start);
window.addEventListener('blur', stop);
resize();
if (window.DEBUG) {
var gui = new dat.GUI();
// gui.add(settings, 'debug');
settings.gui.add(settings, 'trails', 1, ).onChange(reset);
settings.gui.add(settings, 'size', , ).onFinishChange(reset);
settings.gui.add(settings, 'friction', 0., 0.).onFinishChange(reset);
settings.gui.add(settings, 'dampening', 0., 0.4).onFinishChange(reset);
settings.gui.add(settings, 'tension', 0., 0.).onFinishChange(reset);
document.body.appendChild(ctx.stats.domElement);
}
};
})(window);
</script>
</body>
</html>
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